En su etapa inicial en el año 1965 conto con 41 estudiantes de sexo masculino en la jornada diurna; al mismo tiempo que empeso a funcionar la jornada nocturna con 25 estudiantes. En su comienzo la institución fue dirigida por el docente victoriano quiñonez. En 1967 se organizaron todos los grados de primaria con un total de 125 estudiantes.

para el año de 1965 la escuela toma el nombre de 'Concentración de varones Juan José Rondón No.53' la cual fue aprobada por la Secretaria de la Educación Departamental.

En la decada de 1975-1985 se implementa el programa de educacion del plan de desarrollo ejecutado por la C.V.C para Buenaventura, el cual contemplaba la construccion de la planta fisica de (9) construcciones escolares, la institución Juan Jose Rondon fue una de las 3 primeras en entrar en funcionamiento, Inicio labores el dia 14 de octubre de 1982 con 1625 estudiantes, 35 docentes, con modalidad en doble accion.

A traves de los años, esta institucion ha ofrecido los niveles de educacion pre-escolar, educacion basica, hasta llegar a ofrecer la educación media. Es decir la institución ha ido respondiendo a las necesidades de la población estudiantil.